目前，有源滤波器存在多种拓扑结构，根据不同的应用角度，有不同的分类。

根据接入电网的不同形式，有源滤波器可以分为串联型、并联型和串一并联型三大类。

串联型有源滤波器连接到耦合变压器副端，通过耦合变压器串联接入被补偿的电力系统中。对于电网来说，串联型有源滤波器等效为一个受控电压源，其主要功能是消除电压谐波。串联型有源滤波器有很大的缺点，首先，这种形式的有源滤波器只能应用在交流系统中，不能应用在直流系统中，因为系统中的直流电流会将耦合变压器系统接入侧直流磁化；其次，串联型有源滤波器由于是串联接入到系统中的，工作时流过的电流为负载中的所有负荷电流，因此损耗较大；再次，串联型有源滤波器的各种保护实现也非常复杂，因此，目前串联型有源滤波器的应用实例较少。